Árið 2003 var verkið boðið út og var hagstæðasta tilboði tekið, frá Borgarverk, sem hljóðaði upp á 80,3 milljónir króna. Framkvæmdum var hagað þannig að sem minnst rask yrði og var flugbrautin einungis lokuð í þrjá daga á framkvæmdatímanum.

Flugbrautin hefur öll verið endurbyggð og er nú 1.030 metra löng og 23 metra breið. Lögð var klæðning á brautina og byggð við hana endaöryggissvæði, þá var jafnframt byggð ný vélageymsla á flugvellinum. Vélageymslan sem er 140 fermetrar að stærð hýsir slökkvibifreið, rafmagnsbúnað, snjóruðningstæki, blásara og sanddreifara. Elin á Sauðárkróki sá um byggingu hússins og nam kostnaður við hana 18 milljónum króna.